全民奇迹2中的技能使用确实存在多方面的限制条件，这些限制构成了游戏角色培养与战斗策略的核心部分。技能升级作为提升战斗力的主要途径，其本身就需要消耗特定资源并遵循游戏规则。玩家在技能界面选择所需技能后，点击升级按钮进行操作，但升级过程需要消耗经验值或特定的技能点与材料，技能点主要通过角色升级和完成特定任务获取，资源在游戏前期通常较为紧缺，因此玩家需要合理规划，优先将资源集中在主力输出技能和关键被动技能上，而非平均分配。
不同职业及其转职分支的技能体系存在专属的特性与使用门槛，这构成了另一层限制。以战士为例，其核心输出技能如无畏冲锋和回旋斩各有侧重，而控制技能如怒斩附带击退效果。转职后，例如选择斗士或魔剑士路线，技能选择会更丰富，但同时也意味着必须在该路线下进行搭配。对于魔法师职业，其高阶分支如皇家魔法师或禁法师，技能限制体现在较长的冷却时间与高额的魔法值消耗上，这要求玩家必须合理规划技能释放顺序。部分高级技能或被动效果的解锁，往往与角色达到特定的转职阶段直接挂钩，例如五转骑士才能激活某些高级被动，玩家无法提前使用。
技能的使用与切换直接受到冷却时间和各类资源消耗的制约。每次施放技能后都会进入冷却，而强力技能的释放不仅消耗魔法值或能量点，部分技能还可能依赖特定道具或条件。禁法师的技能在切换时系统会设定冷却时间，不能无限制频繁更换。这些设计使得玩家在战斗中必须注重资源管理与技能循环的规划，避免在关键时刻因资源枯竭或技能全部处于冷却而陷入被动。技能的升级可以缩短冷却或提升效果，但这同样需要持续的资源投入。
游戏存在明确的槽位数量限制。技能装配界面默认提供有限的主动技能槽位，目前无法通过任何方式增加技能槽位超过5个。这意味着玩家需要从已解锁的技能中，根据职业特点和战斗场景精选出最合适的组合。例如在PVE场景中可能侧重范围伤害技能以快速清怪，而在PVP中则需要搭配控制与位移技能以应对玩家对抗。这种槽位限制迫使玩家进行策略性取舍，而非追求技能数量，通过研究技能之间的联动效果来最大化输出效率。
技能系统的限制还延伸至与其他养成系统的关联。精灵技能的开启与运用就是一个典型例子，玩家需要达到4转等级方可解锁精灵技能系统，而精灵技能的装配不仅需要消耗技能书，还受到精灵自身类型的限制。装备系统也会间接影响技能效果，例如穿戴防御型装备可能会增强格挡类被动的效果，而选择增加魔法攻击的武器词缀能直接提升技能伤害。翅膀注灵、宝石镶嵌等系统可以提供冷却缩减、魔法回复等增益，从而部分缓解技能使用的限制，但这些增益通常需要玩家投入大量资源进行培养。
